福建农林大学研究生院自2005年成立以来，是全国首批硕士学位授权单位之一，也是福建省深化高等教育综合改革的重要组成部分。该研究生院致力于提升研究生培养质量，建设高水平学术科研平台，推动学科交叉与创新，为国家和地方社会经济发展培养高水平创新型人才。
福建农林大学研究生教育注重实践与理论相结合的特色培养，不断探索和完善教育教学体制改革，努力为学生提供一流的教育和研究环境。研究生院目前设有生命科学、林学、资源与环境科学、食品科学、农业工程、动物医学六个学科门类下的23个硕士学位授权类别。其中，林学是福建省首批重点学科，农业工程是福建省重点学科。
福建农林大学研究生院的充沛师资力量为学生提供了良好的学术支持和科研环境。现有教师299人，其中博士研究生导师68人，教授68人，副教授132人。学院还吸引了一大批国内外优秀专家和著名学者来学院讲学、交流和合作研究。目前，学院正积极推进国际化办学，与美国、澳大利亚、加拿大、新西兰、意大利等国家的知名高校签订了校际合作协议，开展了一系列科研合作、师资交流和学生交流项目。
在未来的工作中，福建农林大学研究生院将坚持团结奋进、追求卓越、校企合作、产学研深度融合的办学理念，推进学科交叉与融合，以建设一流研究生教育基地、为国家和地方的经济建设服务、打造学术精英培养和创新创业平台为目标，为培养更多有为青年人才做贡献。